Gejala awal busuk akar sering mengecoh karena mirip dengan kekurangan unsur hara atau kekeringan, yaitu daun layu, menguning, dan gugur sebelum waktunya. Petani perlu membongkar atau memeriksa pangkal batang secara berkala untuk melihat apakah ada jaringan kulit akar yang melunak, menghitam, dan berbau busuk.
Curah hujan yang tinggi memperburuk kondisi tanah liat yang padat dan kurang drainase. Air hujan yang menggenang di sekitar perakaran mangga memotong suplai oksigen ke dalam tanah, membuat akar lemas, membusuk, dan membuka jalan bagi patogen tular tanah untuk masuk merusak jaringan tanaman.
Penanganan yang efektif membutuhkan kombinasi perbaikan drainase lahan, pengurangan kelembapan tanah, dan aplikasi agen hayati yang sesuai. Dengan tindakan korektif yang cepat, tanaman mangga dapat memulihkan sistem perakarannya dan kembali menyerap nutrisi dengan optimal.