Hama penghisap cairan seperti kutu putih, kutu perisai, dan tungau laba-laba biasanya meningkat populasi dan intensitas serangannya pada musim kemarau antara bulan April hingga Oktober. Pengamatan rutin pada balik daun dan ketiak cabang sekurang-kurangnya dua kali dalam seminggu sangat disarankan untuk mendeteksi koloni hama sebelum menyebar luas ke seluruh mahkota bonsai.
Memasuki musim hujan dari bulan November hingga Maret, kelembapan yang tinggi sering memicu kemunculan ulat pengunyah daun dan hama bekicot kecil. Serangan ulat dapat menghabiskan pucuk muda bonsai dalam waktu singkat, sehingga mengganggu pola percabangan dan memperlambat pemulihan bentuk tajuk yang diinginkan.
Langkah pencegahan terbaik adalah menjaga kebersihan area sekitar rak bonsai, mengarantina tanaman baru selama 14 hari, dan memperbarui media tanam poros seperti campuran pasir malang dan pumice secara berkala setiap 1 hingga 2 tahun sekali. Sanitasi lingkungan bertindak sebagai benteng utama dalam menekan perkembangbiakan vektor penyakit.
