Infeksi bakteri Ralstonia solanacearum ditandai dengan daun kencur yang layu mendadak dan menguning dalam waktu 3 sampai 5 hari, sedangkan rimpang yang terinfeksi mengeluarkan lendir berbau busuk khas saat ditekan. Penyakit ini sangat cepat menular antarbedengan melalui aliran air drainase yang terkontaminasi.
Serangan jamur Pythium sp. atau Fusarium sp. memberikan gejala rimpang melunak, kecokelatan, serta terdapat miselium putih tipis di sekitar pangkal batang. Pembusukan akibat jamur ini memuncak pada kelembapan tanah di atas 85 persen, terutama jika petani menggunakan pupuk kandang mentah yang belum terkomposkan sempurna.
Pencegahan pembusukan membutuhkan pembuatan bedengan setinggi 30 sampai 40 cm dengan lebar 100 cm, serta aplikasi agen hayati Trichoderma sp. sebanyak 20 gram per tanaman saat awal tanam. Apabila gejalanya sudah parah pada 15 persen populasi tanaman, segera lakukan pembongkaran tanaman sakit dan sanitasi tanah bekas tancapan dengan kapur pertanian.
