Gejala awal serangan busuk akar pada kemangi ditandai dengan daun yang melayu dan menguning secara mendadak meskipun tanah terlihat basah. Jika tanaman dicabut dari media, akar yang seharusnya berwarna putih segar berubah menjadi cokelat kehitaman, terasa lunak berair, berbau busuk, dan mudah putus saat dipegang.
Untuk mencegah penyebaran infeksi patogen tanah seperti Pythium sp., lakukan penyiraman secukupnya yaitu 1 kali sehari pada pagi hari jika tidak ada hujan, atau hentikan penyiraman sama sekali saat hujan turun setiap hari. Pemangkasan rutin 2 hingga 3 cm pada pucuk tanaman setiap 2 minggu juga membantu membatasi beban evaporasi tanaman yang akarnya terganggu.
Pengelolaan media tanam dengan menambahkan racikan pasir malang dan arang sekam dengan perbandingan 1:1 pada tanah gembur akan meningkatkan porositas media. Langkah sanitasi lahan dengan mencabut tanaman yang terinfeksi parah dan membuangnya jauh dari area kebun sangat efektif menekan penularan spora jamur.
