Memasuki fase generatif saat tanaman mulai menunjukkan tanda pembungaan, jenis pupuk harus segera diganti dengan kandungan fosfor dan kalium yang tinggi. Pemberian unsur hara ini dilakukan setiap dua hingga tiga minggu sekali menjelang musim kemarau atau saat transisi agar bunga tidak rontok dan kualitas buah terjaga dengan optimal.
Aplikasi pupuk organik padat seperti pupuk kandang matang sebanyak sepuluh hingga dua puluh kilogram per pohon wajib diberikan setiap enam bulan sekali pada awal musim hujan. Cara aplikasinya adalah dengan membuat parit melingkar di bawah tajuk daun bagian luar, bukan tepat di batang utama, untuk memaksimalkan penyerapan oleh akar rambut tanaman.
Selain pupuk makro, pemberian pupuk mikro tambahan lewat penyemprotan daun pada pagi hari sangat membantu mencegah defisiensi unsur hara penting seperti boron dan kalsium. Petani dianjurkan selalu memantau kondisi cuaca lokal dan tingkat kelembapan tanah sebelum melakukan pemupukan agar efisiensi penyerapan nutrisi oleh tanaman jambu air mencapai hasil maksimal.