Kekurangan nitrogen (N) menyebabkan daun bagian bawah menguning merata, dimulai dari ujung daun. Pada tembakau, defisiensi N sering terjadi di tanah berpasir atau saat pemupukan tidak sesuai dosis. Solusinya: beri pupuk urea atau ZA sesuai rekomendasi BPP setempat, dengan dosis 100-150 kg N/ha terbagi 2-3 kali aplikasi.
Serangan virus, seperti Tobacco Mosaic Virus (TMV), menyebabkan daun menguning berbentuk mosaik (bercak kuning hijau). Virus ditularkan melalui alat panen atau serangga. Tidak ada obat, jadi fokus pada pencegahan: gunakan bibit sehat, rotasi tanaman, dan desinfeksi alat. Cabut tanaman sakit dan bakar.
Penyakit layu bakteri (Ralstonia solanacearum) juga menyebabkan daun layu dan menguning, terutama pada musim hujan. Ciri khas: potong batang, akan keluar lendir bakteri. Solusi: perbaiki drainase, aplikasi pupuk kandang matang, dan lakukan rotasi dengan padi atau jagung minimal 2 tahun.