Penyakit busuk umbut (bud rot) dan gugur buah (fruit drop) menjadi ancaman utama yang dapat menurunkan produksi kopra hingga 40 persen jika tidak ditangani secara cepat. Pengamatan rutin minimal 1 minggu sekali pada tajuk dan pangkal pelepah sangat disarankan selama puncak musim hujan antara bulan November hingga Maret.
Sanitasi kebun merupakan langkah paling krusial dalam memutus rantai penularan patogen. Pemangkasan pelepah tua yang bergejala infeksi harus dilakukan secara berkala setiap 2 minggu, diikuti dengan pembersihan gulma di sekitar piringan pohon sejauh 1,5 meter dari batang utama.
Aplikasi agen hayati seperti Trichoderma sp. pada area perakaran sebanyak 200 hingga 250 gram per pohon di awal musim hujan terbukti ampuh memperkuat daya tahan tanaman. Jika serangan sudah meluas, tindakan saniter dan konsultasi teknis dengan Petugas Pengendali Organisme Pengganggu Tumbuhan (POPT) lokal sangat dianjurkan.
