Pada fase vegetatif atau umur 1 hingga 3 tahun, fokus utama pemupukan gowok adalah pembentukan percabangan dan tajuk daun yang sehat. Berikan pupuk organik terfermentasi setiap 4 bulan sekali sebanyak 5 kg per pohon, diimbangi dengan pupuk NPK seimbang (15-15-15) sebanyak 100 hingga 250 gram per pohon yang diaplikasikan rutin setiap 3 bulan sekali.
Saat tanaman memasuki fase generatif atau siap berbuah (umur 4 tahun ke atas), kebutuhan unsur Fosfor dan Kalium meningkat pesat untuk memicu pembungaan dan meningkatkan kualitas rasa buah gowok. Menjelang akhir musim hujan (bulan April atau Mei), kurangi porsi Nitrogen dan tingkatkan pupuk kaya Kalium dan Fosfor sebanyak 300 hingga 500 gram per pohon, diberikan dua kali setahun.
Teknik pembenaman pupuk gowok harus dilakukan secara benar agar nutrisi terserap maksimal oleh akar serabut. Buatlah parit melingkar sedalam 10 sampai 15 cm tepat di bawah proyeksi tajuk daun terluar, taburkan pupuk secara merata, lalu tutup kembali dengan tanah galian untuk mencegah pencucian nutrisi oleh air hujan tropis yang deras.