Mengetahui waktu panen gowok secara akurat sangat penting untuk mendapatkan rasa manis keasaman yang segar dan mengurangi tingkat kesepatan. Buah gowok memerlukan waktu perkembangan sekitar 80 hingga 90 hari sejak bunga mekar penuh hingga matang sempurna. Tanda fisik utama kematangan adalah perubahan warna kulit buah dari hijau kekuningan, merah muda, hingga menjadi ungu gelap kehitaman yang rata serta sedikit mengilap di seluruh permukaan dompolan.
Proses pemanenan sebaiknya dijadwalkan pada pagi hari antara pukul 07.00 hingga 09.00 WIB saat suhu udara masih sejuk untuk menekan laju respirasi buah. Pemisahan buah dari pohon dilakukan dengan memotong tangkai dompolan sepanjang 1 hingga 2 cm menggunakan gunting pangkas steril. Jangan memetik dengan cara menarik dompolan secara paksa karena dapat merusak jaringan kulit batang yang menjadi tempat keluarnya bunga pada musim berikutnya.
Daya simpan buah gowok tergolong singkat karena tekstur daging buahnya yang juicy. Pada suhu ruang berkisar 25 hingga 28 derajat Celsius, buah segar hanya mampu bertahan selama 3 hingga 5 hari sebelum kulitnya keriput dan membusuk. Penyimpanan di lemari pendingin pada suhu 8 hingga 10 derajat Celsius dengan wadah plastik berlubang dapat memperpanjang masa kesegaran buah gowok hingga 10 sampai 14 hari.