Pengendalian secara biologis dan sanitasi kebun harus menjadi prioritas utama para petani. Pembersihan gulma serta buah busuk yang gugur dalam radius 5 hingga 10 meter dari pangkal batang wajib dilakukan dua kali seminggu. Pemasangan perangkap pemikat lalat buah sebanyak 2 sampai 4 titik per pohon terbukti menekan populasi hama betina secara signifikan ketika bakal buah baru berukuran 3 hingga 5 cm.
Praktek pembungkusan buah muda merupakan langkah fisik paling praktis dan aman untuk melindungi cempedak. Pembungkus dari karung beras, kertas semen, atau jaring khusus dipasang saat diameter buah mencapai 5 cm dengan menyisakan lubang drainase di bagian bawah. Pemeriksaan kondisi pembungkus perlu dijadwalkan setiap 7 hari sekali untuk memastikan tidak ada genangan air atau sarang serangga di dalamnya.
Pengamatan rutin kondisi tajuk dan batang sebaiknya dijadwalkan setiap 3 sampai 5 hari sekali sepanjang periode pembuahan. Jika tingkat kerusakan akibat hama melebihi ambang batas 5 persen dari total populasi buah di pohon, intervensi pengendali berbahan aktif dapat dipertimbangkan. Selalu konsultasikan penggunaan bahan pengendali dengan petugas penyuluh pertanian setempat agar sesuai dengan azas ketepatan sasaran dan keamanan lingkungan.