Pemberian nutrisi organik berupa pupuk kandang matang sebanyak 15 hingga 20 kg per pohon diberikan 2 kali setahun, yaitu pada awal musim hujan (Oktober-November) dan akhir musim hujan (Maret-April). Lakukan pembuatan rorak atau parit melingkar selebar tajuk pohon setinggi 15 cm untuk memasukkan pupuk tanah agar penyerapan hara oleh akar lateral berjalan optimal.
Pemangkasan pemeliharaan perlu dilakukan setiap 3 hingga 4 bulan sekali untuk membuang tunas air, cabang mati, dan dahan yang bersilangan di dalam tajuk. Langkah ini memastikan sirkulasi udara lancar serta penetrasi cahaya matahari merata, sehingga menurunkan risiko serangan jamur dan merangsang pembentukan bunga di batang utama.
Pengendalian hama lalat buah pada cempedak dilakukan secara fisik dengan membungkus bakal buah menggunakan karung bekas atau plastik berlubang ketika buah berdiameter 5 cm. Sanitasi kebun wajib dijaga dengan membuang buah busuk yang gugur setiap 3 hari sekali agar populasi lalat buah tidak melonjak.