Layu fusarium disebabkan jamur Fusarium oxysporum. Gejala awalnya daun menguning dari ujung, layu, dan pangkal batang membusuk berwarna coklat. Jika batang dipotong melintang, terlihat cincin coklat pada pembuluh. Penyakit ini menular melalui tanah dan alat pertanian. Bercak daun ungu disebabkan Alternaria porri. Gejalanya bercak kecil putih yang membesar jadi ungu kecoklatan, sering mengelilingi daun sehingga daun patah. Bercak juga muncul di umbi dengan warna hitam.
Untuk mengatasi layu fusarium, lakukan rotasi tanaman dengan bukan bawang-bawangan minimal 2 musim. Gunakan bibit sehat dan pastikan drainase baik. Cabut tanaman sakit beserta tanahnya, lalu bakar. Untuk bercak daun ungu, atur jarak tanam agar sirkulasi udara lancar. Siram di pagi hari agar daun cepat kering. Semprotkan fungisida berbahan aktif mankozeb atau klorotalonil sesuai label jika serangan berat.
Pencegahan lebih baik daripada mengobati. Tanam kucai di bedengan tinggi agar tidak tergenang. Beri mulsa jerami untuk mengurangi percikan tanah ke daun. Pantau tanaman setiap minggu, terutama setelah hujan. Jika lebih dari 30% tanaman terserang, segera konsultasi ke penyuluh pertanian setempat untuk rekomendasi pengendalian terpadu.