Penyebab utama daun menguning adalah drainase tanah yang buruk sehingga akar tergenang air. Pada musim kemarau, pohon namnam membutuhkan penyiraman sebanyak 10 hingga 15 liter per pohon setiap 2 hari sekali, namun pada musim hujan penyiraman harus dihentikan total dan buat selokan drainase sedalam 20 centimeter di sekeliling tajuk agar air tidak menggenang.
Defisiensi unsur hara nitrogen dan zat besi juga membuat daun muda maupun tua kehilangan warna hijaunya. Berikan pupuk kompos atau pupuk kandang matang sebanyak 10 hingga 15 kilogram per pohon setiap 4 bulan sekali, dikombinasikan dengan pupuk NPK seimbang sebanyak 150 gram per pohon setiap 3 bulan untuk menjaga kesuburan tanah pada pH ideal 5,5 hingga 6,5.
Pengamatan rutin pada permukaan bawah daun wajib dilakukan setidaknya 2 kali seminggu untuk mendeteksi serangan hama seperti kutu putih atau tungau merah. Pemangkasan cabang yang terlalu rimbun perlu dilakukan 1 tahun sekali guna memungkinkan sinar matahari masuk ke area dalam tajuk dan mencegah kelembapan berlebih yang memicu jamur akar.