Waktu panen lobi-lobi yang paling pas dicirikan oleh perubahan warna kulit buah secara mencolok. Buah muda yang awalnya berwarna hijau terang akan berubah menjadi merah cerah, lalu semakin tua menjadi merah tua keunguan atau marun gelap. Tekstur daging buah yang siap panen terasa sedikit membal atau lunak saat ditekan perlahan dengan jari tangan, serta memiliki aroma khas manis keasaman yang cukup tajam.
Teknik memetik buah lobi-lobi harus dilakukan dengan hati-hati karena kulit buahnya tergolong tipis dan mudah memar. Gunakan gunting pangkas bersih atau petik secara manual dengan menyisakan 0,5 centimeter tangkai buah agar buah tidak cepat membusuk. Lakukan pemetikan secara berkala setiap 3 hingga 5 hari sekali selama masa puncak berbuah, dan hindari menggoyang batang pohon secara kasar agar buah yang belum matang tidak ikut berguguran.
Setelah dipetik, tangani hasil panen lobi-lobi dengan cepat karena masa simpan buah segar pada suhu ruang hanya bertahan sekitar 2 hingga 4 hari saja. Cuci buah dengan air bersih yang mengalir, keringkan, lalu simpan dalam wadah berlubang pada suhu 15 hingga 20 derajat Celsius jika ingin memperpanjang kesegarannya hingga 7 hari. Buah ini sangat cocok langsung diolah menjadi manisan, sirup, atau rujak untuk meningkatkan nilai ekonomisnya.