Penyakit bercak daun yang disebabkan oleh infeksi jamur patogen sering memicu gugurnya daun muda secara prematur, sehingga mengurangi kapasitas fotosintesis tanaman secara drastis. Penyiraman yang berlebihan atau curah hujan tinggi yang menggenangi zona perakaran setinggi 5 hingga 10 cm selama lebih dari 24 jam juga mempercepat timbulnya serangan busuk akar dan pangkal batang.
Pengendalian penyakit pada tanaman lobi-lobi berfokus pada pemeliharaan sirkulasi udara melalui pemangkasan cabang teratur setiap 3 hingga 4 bulan sekali. Pembuangan serta pemusnahan bagian tanaman yang terinfeksi secara rutin dapat memutus siklus hidup jamur sebelum menyebar ke pohon sehat di sekitarnya.
Pemberian pupuk organik terkompos matang sebanyak 10 hingga 15 kg per pohon setiap awal musim hujan sangat efektif memicu ketahanan alami tanaman terhadap patogen. Apabila gejala penyakit menetap dan meluas, tindakan pengendalian hayati atau teknis sesuai arahan penyuluh setempat sangat direkomendasikan.