Pemupukan berimbang menjadi kunci utama agar pohon duku tumbuh subur dan cepat berbuah. Pohon berumur di atas 5 tahun perlu diberikan pupuk organik matang sebanyak 20 hingga 40 kilogram per pohon pada awal musim hujan sekitar bulan Oktober atau November. Dampingi pula dengan pupuk NPK seimbang sebanyak 1 hingga 2 kilogram per pohon yang diaplikasikan secara melingkar di bawah tajuk luar sebanyak dua kali dalam setahun.
Sistem drainase di sekitar piringan pohon harus dijaga dengan baik karena tanaman duku sangat sensitif terhadap genangan air. Buat parit drainase seluas 1,5 meter mengelilingi pohon untuk mengalirkan kelebihan air saat puncak musim hujan di bulan Januari dan Februari. Genangan air yang dibiarkan berhari-hari dapat memicu pembusukan akar dan mematikan tanaman secara perlahan.
Pemangkasan tajuk dilakukan secara berkala untuk menjaga sirkulasi udara dan pencahayaan di dalam rimbunan daun. Pascapanen pada bulan Maret atau April, pangkas tunas air, cabang yang saling bersilangan, serta ranting kering. Pemangkasan rutin ini akan merangsang pembentukan tunas baru yang sehat sekaligus menekan risiko serangan hama penggerek batang.